"El Southampton puede confirmar que ha mantenido conversaciones con el entrenador del primer equipo masculino, Rubén Sellés, y ha decidido que su contrato no será renovado cuando expire al final de la temporada", dijo el club en un comunicado.
"Rubén se hará cargo del equipo para el último partido contra el Liverpool el domingo en St Mary's".
"Le deseamos todo lo mejor para su futura carrera".
Sellés asumió el cargo de entrenador del Southampton en enero tras haber sido anteriormente ayudante tanto de Ralph Hasenhuttl (55) como de Nathan Jones (49) en el banquillo de los Saints.
El español sólo ha ganado dos partidos de 16 como entrenador desde que asumió el cargo en enero: contra el Chelsea y el Leicester City.
El Southampton se dispone a nombrar nuevo entrenador al técnico del Swansea, Russell Martin (37), según informan los medios británicos.