El irlandés, de 22 años, se impuso con un crono de siete minutos, 40 segundos y 94 centésimas, por delante del australiano Elijah Winnington (7:42.95) y del italiano Gregorio Paltrinieri (7:42.98).
El vigente campeón mundial de la distancia, el tunecino Ahmed Hafnaoui, había quedado eliminado en las series.
Wiffen, cuarto en los 800 metros en el Mundial del año pasado en Fukuoka, había llegado a Catar con grandes esperanzas tras haber batido el récord del mundo de la distancia en piscina corta el pasado diciembre, durante el Europeo de Bucarest.
"Todo ha sido subir, subir y subir. Terminar esta parte de la temporada con una medalla de oro mundial es algo increíble", afirmó el irlandés, que había sido apenas séptimo al principio de la semana en la final de los 400 metros.
En los 200 metros libre, la hongkonesa Siobhan Haughey, que afrontaba la cita tras haber sido subcampeona mundial de 100 metros libre el año pasado y bronce esta semana en los 200 metros braza, brilló con luz propia.
"Soy la primera, pero espero que haya más en el futuro. Tenemos un equipo muy joven aquí y creo que es estupendo para ellos competir mundialmente. Espero que en unos años también sean campeones del mundo", deseó.
En la final de 200 metros mariposa, el japonés Tomoru Honda fue campeón (1:53.88), mientras que el australiano Sam Williamson se coronó en 50 metros braza y Estados Unidos triunfo en el relevo 4x100 m estilos mixto.
Resultados de las finales del miércoles
- HOMBRES
800 m libre
Oro: Daniel Wiffen (IRL), 7:40.94
Plata: Elijah Winnington (AUS), 7:42.95
Bronce: Gregorio Paltrinieri (ITA) 7:42.98
200 m mariposa
Oro: Tomoru Honda (JPN), 1:53.88
Plata: Alberto Razzetti (ITA), 1:54.65
Bronce: Martin Espernberger (AUT), 1:55.16
50 m braza
Oro: Sam Williamson (AUS), 26.32
Plata: Nicolo Martinenghi (ITA), 26.39
Bronce: Nic Fink (USA), 26.49
- MUJERES
200 m libre
Oro: Siobhan Haughey (HKG), 1:54.89
Plata: Erika Fairweather (NZL), 1:55.77
Bronce: Brianna Throssell (AUS), 1:56.00
- MIXTO
Relevo 4x100 m estilos
Oro: Estados Unidos, 3:40.22
Plata: Australia, 3:43.12
Bronce: Gran Bretaña, 3:45.09