El estadounidense ha puesto fin a una sequía que se remontaba a su triunfo en el British Open la temporada pasada, logrado dos meses después de conquistar su primer major en el PGA Championship.
Schauffele, que ganó el oro olímpico en Tokio en 2021, ha terminado con un total de 19 bajo par tras una última ronda de 64 golpes, siete bajo par, en la que firmó ocho birdies y un bogey en el Yokohama Country Club.
Con mucha calma, embocó un putt corto para sellar la victoria, se quitó la gorra para saludar al público y abrazó a su caddie.
"Se siente bien, es agradable saber que todavía lo tengo", ha declarado Schauffele, quien ha tenido problemas de lesiones a principios de la temporada.
"Ha sido un año duro, pero mi equipo me ha ayudado a superarlo."
Schauffele, que formó parte del equipo estadounidense derrotado en la Ryder Cup hace dos semanas, comenzó la última ronda empatado en el liderato con Greyserman.
Ambos fueron alcanzados rápidamente por Michael Thorbjornsen después de que el estadounidense de 24 años lograra un eagle en el hoyo 4.
Schauffele se quedó solo en cabeza tras el hoyo 14 y ya no soltó el liderato, ampliando su ventaja a dos golpes con un birdie sin nervios en el 17.
Greyserman intentó recortar distancias en el último momento, pero su intento de eagle en el hoyo final se quedó dolorosamente corto.
Schauffele ha destacado que ha sido "especial" lograr su décima victoria en el PGA Tour en Japón, país donde creció su madre y donde aún viven sus abuelos.
"Ojalá esté encontrando mi mejor forma", ha comentado.
"La lesión de este año ha sido una gran lección para mí."
Greyserman buscaba su primer título en el PGA Tour tras haber sido subcampeón en cuatro ocasiones, incluida la edición del año pasado en Japón.
Thorbjornsen ha finalizado tercero, a tres golpes de Schauffele.
El compañero de Schauffele en la Ryder Cup, Collin Morikawa, ha terminado empatado en el puesto 14 con 10 bajo par.
El japonés Hideki Matsuyama ha compartido la vigésima posición con ocho bajo par.
El estadounidense Matt McCarty ha firmado la mejor vuelta del día, con 12 birdies para un total de 60 golpes.
McCarty, que encadenó ocho birdies consecutivos en los últimos nueve hoyos, hizo bogey en el 18 y se quedó sin la hazaña de bajar de 60 golpes.
El Baycurrent Classic es actualmente el único torneo del PGA Tour estadounidense que se disputa en Asia.
Anteriormente se conocía como Zozo Championship y se celebró por primera vez en 2019, cuando Tiger Woods fue el primer campeón. Matsuyama lo ganó en 2021.