De 18 años, integró el centro de formación del equipo de su ciudad natal, Brescia, en 2009, después siguió formándose en el Atalanta a partir de 2013, antes de firmar su primer contrato profesional con el Benfica en 2020.

El jugador de 1,90 metros de altura debutó con el primer equipo del club de Lisboa en marzo de 2023, con el que conquistó la liga portuguesa.

Cher Ndour, que lucirá el número 27, declaró en un comunicado que está "muy emocionado" por firmar un contrato de cinco años con el PSG, "uno de los mejores clubes del mundo".

Se trata del sexto refuerzo del PSG para la próxima temporada, después de, entre otros, el defensor francés Lucas Hernández (Bayern Múnich), el volante ofensivo español Marco Asensio (Real Madrid) o el central eslovaco Milan Skriniar (Inter Milán).