El técnico croata sustituirá así a Nuri Sahin, despedido el pasado miércoles. Desde entonces ocupaba el puesto de manera interina Mike Tullberg.
Según el diario alemán Bild, Kovac y el Borussia Dortmund llegaron a un "principio de acuerdo".
Kovac, que entrenó al Mónaco de 2020 a 2022 y al Wolfsburgo de 2022 a 2024, ganó la Copa de Alemania con el Eintracht Fráncfort contra el Bayern en 2018, antes de aceptar el puesto de entrenador principal del club muniqués, unas semanas más tarde.
En el Bayern consiguió el doblete Bundesliga-Copa en el curso 2018-2019, pero fue despedido por el club bávaro en mitad de la siguiente temporada.
Conocido por su disciplina y por la importancia que da la condición física, Kovac tomará las riendas del Dortmund, que desde la final de la Liga de Campeones de junio acumula problemas.
El Borussia Dortmund es 11º en la Bundesliga, a 22 puntos del líder, el Bayern.
En la Liga de Campeones ganó 3-1 al Shakhtar este miércoles y se clasificó para los play-offs de acceso a octavos de final al terminar 10º en el grupo único del máximo torneo europeo.